معاونت درمان دانشگاه علوم پزشکی بابل، یکی از هفت معاونت دانشگاه است که زیر نظر ریاست دانشگاه فعالیت می کند. معاونت درمان، مسئولیت مدیریت، برنامه ریزی و نظارت بر امور حوزه درمان دانشگاه را بر عهده دارد.

هدایت فعالیت های درمانی دانشگاه و پشتیبانی از حوزه های مختلف خدمات دهی بیمارستانی را برعهده دارد.

از جمله فعالیتهای مهم این معاونت شامل حوزه های : صدور پروانه ها ، نظارت بر امور درمان ( بیمارستانی و غیر بیمارستانی)، نظارت و اعتبار بخشی ، پایش مراقبت های درمانی ، اورژانس ، توسعه و برنامه ریزی ، رسیدگی به تخلفات تعزیراتی،شورای پزشکی ، امور بیماریها ، حوزه IT ,HIS بیمارستانی ، اقتصاد درمان ، مامایی، امور متخصصین ، اسناد و مدارک پزشکی ، تغذیه ، مدیریت پرستاری ، بهداشت محیط ، مددکاری ،آزمایشگاه و ... ، از جمله فعالیت های این معاونت می باشد .